RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 KCNB1Q14721 858 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC6Q16204 474 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 P2RX5Q93086 422 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 EVI5O60447 810 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PEX26Q7Z412 305 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CABP7Q86V35 215 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MKNK2Q9HBH9 465 aa13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PALLDQ8WX93 1383 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 POLE2P56282 527 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MXRA7P84157 204 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 STK4Q13043 487 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 TAF11Q15544 211 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 GDAP1Q8TB36 358 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 DNM1LO00429 736 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SEMA3EO15041 775 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ANP32DO95626 131 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MMEP08473 750 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 HLFQ16534 295 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA5Q8NB90 893 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MTMR8Q96EF0 704 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 GLI3P10071 1580 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 FSBPO95073 299 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 RNF217Q8TC41 542 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 RAPGEF5Q92565 580 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 NDST4Q9H3R1 872 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.13□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 RGPD5Q99666 1765 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 USP17L12C9JPN9 530 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 USP17L21D6R901 530 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 LIFRP42702 1097 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 VPS41P49754 854 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PPP2R2AP63151 447 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 VSIG1Q86XK7 387 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PLCG1P19174 1290 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 EVA1CP58658 441 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ATP11AP98196 1134 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 AMPD3Q01432 767 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MMGT1Q8N4V1 131 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SH2D4AQ9H788 454 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 H7C1W4 665 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 HSD17B3P37058 310 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 NAPAP54920 295 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SNX1Q13596 522 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa13.12□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CPDO75976 1380 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SCN11AQ9UI33 1791 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PBX1P40424 430 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 KDM7AQ6ZMT4 941 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SH3GL2Q99962 352 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 MCM8Q9UJA3 840 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 EPHB6O15197 1021 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 FOXP2O15409 715 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 KLRC1P26715 233 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SWAP70Q9UH65 585 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 TBK1Q9UHD2 729 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 SNX24Q9Y343 169 aa13.11□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 NBPF26B4DH59 902 aa13.1□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM37O94972 964 aa13.1□□□□□ -0.31
PRRX1-207ENST00000497230 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms