RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 GJA10Q969M2 543 aa22.37■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.37■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PSMA7O14818 248 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 INPP5BP32019 993 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PDE4DQ08499 809 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.36■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 MARCH6O60337 910 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 POLR2MP0CAP2 368 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 GHRHRQ02643 423 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 KRT31Q15323 416 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PRR16Q569H4 304 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 ZNF536O15090 1300 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 STK4Q13043 487 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 CCDC174Q6PII3 467 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 LDHDQ86WU2 507 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 FEZ1Q99689 392 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 THAP9Q9H5L6 903 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 TEX33O43247 280 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 ICAM1P05362 532 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 CCNE1P24864 410 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 DCAF15Q66K64 600 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D5Q92609 795 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 STK24Q9Y6E0 443 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 MSH4O15457 936 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 TMEM139Q8IV31 216 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 WDR18Q9BV38 432 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 VAV3Q9UKW4 847 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-211ENST00000492185 RLFQ13129 1914 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 KCNJ18B7U540 433 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 COBLO75128 1261 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 HSD17B4P51659 736 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 KCNJ12Q14500 433 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 P2RX5Q93086 422 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 HOOK2Q96ED9 719 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 NRDCO43847 1150 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 CFBP00751 764 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 FCER1AP12319 257 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 PTPN21Q16825 1174 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 TC2NQ8N9U0 490 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 DDX12PQ92771 950 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 BICDL2A1A5D9 508 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 MED24O75448 989 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 STAT3P40763 770 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 PSMD2Q13200 908 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 CENPPQ6IPU0 288 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 GPC2Q8N158 579 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 LMNB1P20700 586 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 RPA1P27694 616 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 RPTORQ8N122 1335 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 POTEB3A0JP26 581 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 USP27XA6NNY8 438 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 POTECB2RU33 542 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 POTEBQ6S5H4 581 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 ERMNQ8TAM6 284 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-211ENST00000492185 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms