RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 FOXN1O15353 648 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 OSBPP22059 807 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 SLC30A10Q6XR72 485 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CAVIN2O95810 425 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 HERVK_113P62684 666 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 GJA10Q969M2 543 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 PAGE5Q96GU1 130 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 MAF1Q9H063 256 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 POTEMA6NI47 508 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CEP55Q53EZ4 464 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CALML4Q96GE6 196 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 PDXDC2PQ6P474 469 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 BTBD7Q9P203 1132 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 MSH4O15457 936 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 AFMP43652 599 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 KRT79Q5XKE5 535 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PLA2G4DQ86XP0 818 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CHST13Q8NET6 341 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 FAM200AQ8TCP9 573 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 TAAR1Q96RJ0 339 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 UIMC1Q96RL1 719 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC25Q9H1X3 360 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 BIN1O00499 593 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CETPP11597 493 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 GTF2A2P52657 109 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 POTEEQ6S8J3 1075 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCE1Q969G3 411 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 RMDN3Q96TC7 470 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0G2JMZ2 1700 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 FRMPD4Q14CM0 1322 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PRR29P0C7W0 189 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PCNX4Q63HM2 1172 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 RIOX2Q8IUF8 465 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CUEDC2Q9H467 287 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SMC2O95347 1197 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PLCG1P19174 1290 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CST9Q5W186 159 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SNX29Q8TEQ0 813 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PLIN2Q99541 437 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PAGR1Q9BTK6 254 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SPATC1LQ9H0A9 340 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MEIS1O00470 390 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF165P49910 485 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP12P59046 1061 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF16Q5VV41 709 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO40Q9UH90 709 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 A0A087WWV3 80 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 NAALADL2Q58DX5 795 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 NT5DC1Q5TFE4 455 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PXMP2Q9NR77 195 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CYP39A1Q9NYL5 469 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PNMA3Q9UL41 463 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 IL31RAQ8NI17 732 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MAGEF1Q9HAY2 307 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PGM5Q15124 567 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 UVSSAQ2YD98 709 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PEX10O60683 326 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SARSP49591 514 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CCL15Q16663 113 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SPRYD7Q5W111 196 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA20Q8TB22 786 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 PDCD2LQ9BRP1 358 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 CBX8Q9HC52 389 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXB3-210ENST00000489475 DPCR1Q3MIW9 517 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 ISM2Q6H9L7 571 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 STAMQ92783 540 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 SLC26A4O43511 780 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 BCRP11274 1271 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 ITGB5P18084 799 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 DPYDQ12882 1025 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 GRB10Q13322 594 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 XRRA1Q6P2D8 792 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXB3-210ENST00000489475 NCAPG2Q86XI2 1143 aa30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms