RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488033.5

HCLS1-209, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 4

Gene HCLS1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-209ENST00000488033 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 TECTAO75443 2155 aa15.91■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 TSPY2A6NKD2 308 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 B4DLN1 442 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 H3BNC9 293 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 M0R2C6 588 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 LGR5O75473 907 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 EDNRBP24530 442 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 CHST3Q7LGC8 479 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 C7orf31Q8N865 590 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 DNERQ8NFT8 737 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 KAT2BQ92831 832 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 ALG1Q9BT22 464 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.9■□□□□ 0.14
HCLS1-209ENST00000488033 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 NMT2O60551 498 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PPARAQ07869 468 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PTK7Q13308 1070 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 CLUL1Q15846 466 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 IER5LQ5T953 404 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RPAINQ86UA6 219 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RNF135Q8IUD6 432 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DCAF4Q8WV16 495 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 NAPBQ9H115 298 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.89■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 NCK2O43639 380 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 GH1P01241 217 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PSEN2P49810 448 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 MBTPS1Q14703 1052 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 COL19A1Q14993 1142 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 LY6KQ17RY6 165 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 TMEM192Q8IY95 271 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 YME1L1Q96TA2 773 aa15.88■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 MBTPS2O43462 519 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 UPP2O95045 317 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 LTBRP36941 435 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ARHGAP1Q07960 439 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DGKDQ16760 1214 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 EDAQ92838 391 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 WNT8BQ93098 351 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PRRX2Q99811 253 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 INCENPQ9NQS7 918 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 MFSD10Q14728 455 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 FBXO11Q86XK2 927 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PNMA2Q9UL42 364 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 EMSYQ7Z589 1322 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 TMEM221A6NGB7 291 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 M0R296 226 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 STXBP3O00186 592 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 GFRA3O60609 400 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RSPH10BP0C881 870 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 TCF15Q12870 199 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 PKN1Q16512 942 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.84■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.84■□□□□ 0.13
HCLS1-209ENST00000488033 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms