RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 USH1GQ495M9 461 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 GMCL1Q96IK5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 AMNQ9BXJ7 453 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.96□□□□□ -0.01
SYCE1-205ENST00000479535 KIF5CO60282 957 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 UBXN4Q92575 508 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 DNAJC7Q99615 494 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC41Q15345 812 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 WDR59Q6PJI9 974 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.95□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CLRN2A0PK11 232 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 E9PMD0 336 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 BMP3P12645 472 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CYP3A7P24462 503 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 STAT3P40763 770 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGAP4P98171 946 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 AP3B2Q13367 1082 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 HYIQ5T013 277 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FBXO11Q86XK2 927 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FEZ1Q99689 392 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEB3A0JP26 581 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTECB2RU33 542 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NDUFA10O95299 355 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGAP25P42331 645 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 POTEBQ6S5H4 581 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MBOAT7Q96N66 472 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.94□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ECE1P42892 770 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 STK32BQ9NY57 414 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RAD17O75943 681 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SPDYE6P0CI01 402 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 COASYQ13057 564 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PSMD2Q13200 908 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PRR16Q569H4 304 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 OPLAHO14841 1288 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SLC35F6Q8N357 371 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NUP58Q9BVL2 599 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 EPC1Q9H2F5 836 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PANK4Q9NVE7 773 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MED24O75448 989 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PLA2G4BP0C869 781 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ERCC3P19447 782 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC63Q05C16 580 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 VWA3BQ502W6 1294 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RETREG2Q8NC44 543 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.92□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FAM86B1E9PN63 330 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.91□□□□□ -0.02
SYCE1-205ENST00000479535 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms