RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFBP00751 764 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TECP42680 631 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SOX10P56693 466 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PNOCQ13519 176 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TKFCQ3LXA3 575 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q4G0T1 1027 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HS1BP3Q53T59 392 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PAGE5Q96GU1 130 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STK17AQ9UEE5 414 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WNT7AO00755 349 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TPM3P06753 285 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CIITAP33076 1130 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPP1R2P41236 205 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNAP25P60880 206 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLCB2Q00722 1185 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COG2Q14746 738 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POTEDQ86YR6 584 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RLFQ13129 1914 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IKBKBO14920 756 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADAMTS3O15072 1205 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TDP2O95551 362 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPATQ06203 517 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WNK4Q96J92 1243 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MBOAT7Q96N66 472 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXCL11O14625 94 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FKTNO75072 461 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ALDH1A1P00352 501 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AFMP43652 599 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HMGCS2P54868 508 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INHBEP58166 350 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GHRHRQ02643 423 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STIM1Q13586 685 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 E2F4Q16254 413 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IL17AQ16552 155 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 USP49Q70CQ1 688 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERO1BQ86YB8 467 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFNL1Q8IU54 200 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MB21D1Q8N884 522 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BIN1O00499 593 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ALAS1P13196 640 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSG3P32926 999 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GJA5P36382 358 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HSD17B4P51659 736 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYL5Q02045 173 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPIL2Q13356 520 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRR16Q569H4 304 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SV2BQ7L1I2 683 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LUZP1Q86V48 1076 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPATA20Q8TB22 786 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM5Q9C035 493 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VWA5AO00534 786 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATP2A1O14983 1001 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC37A4O43826 429 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADCY5O95622 1261 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COPB2P35606 906 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DPYDQ12882 1025 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MORC3Q14149 939 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms