RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476089.1

ITGA4-207, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA4, Length 1,846 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-207ENST00000476089 SV2BQ7L1I2 683 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 DRC7Q8IY82 874 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 LENG9Q96B70 501 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 STK24Q9Y6E0 443 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 OAZ1P54368 228 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ERMNQ8TAM6 284 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 TRERF1Q96PN7 1200 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 PNMA5Q96PV4 448 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 UIMC1Q96RL1 719 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 HOXC10Q9NYD6 342 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 SCN4AP35499 1836 aa23■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 GHRHRQ02643 423 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 PARP14Q460N5 1801 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 MSH4O15457 936 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 KCNB1Q14721 858 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 MYPNQ86TC9 1320 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 UBXN2AP68543 259 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 CEP55Q53EZ4 464 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 LRRC15Q8TF66 581 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 CDC25BP30305 580 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 PPATQ06203 517 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 HYIQ5T013 277 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 SPC24Q8NBT2 197 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 RAD54LQ92698 747 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 TRIM9Q9C026 710 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ELP3Q9H9T3 547 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ERO1BQ86YB8 467 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 WNK4Q96J92 1243 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 RNF146Q9NTX7 359 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 OTOFQ9HC10 1997 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 TPM3P06753 285 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 ASIC1P78348 528 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 MCM6Q14566 821 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 REPS2Q8NFH8 660 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 FANCLQ9NW38 375 aa22.96■■□□□ 1.27
ITGA4-207ENST00000476089 RPTORQ8N122 1335 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 STAT3P40763 770 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 NSMFQ6X4W1 530 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 OTUD5Q96G74 571 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 WDR90Q96KV7 1748 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 RLFQ13129 1914 aa22.95■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 ESPNB1AK53 854 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 ATP2A1O14983 1001 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 RHOBTB3O94955 611 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 STIM1Q13586 685 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TKFCQ3LXA3 575 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 EXOC1Q9NV70 894 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 COL20A1Q9P218 1284 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 MEIS1O00470 390 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 KLRC4O43908 158 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 SERPINC1P01008 464 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ITGA4-207ENST00000476089 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms