RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	DPF3	Q92784	378 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	NID2	Q14112	1375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	LCT	P09848	1927 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	MYH6	P13533	1939 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	OPLAH	O14841	1288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ZBTB43	O43298	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ZEB2	O60315	1214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CABYR	O75952	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CALML3	P27482	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	EVC	P57679	992 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ANAPC15	P60006	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PDE4D	Q08499	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SNX17	Q15036	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TATDN2	Q93075	761 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PIGS	Q96S52	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ELP1	O95163	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		A0A1W2PPC1	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		A0A1W2PQY0	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		H0YGN5	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TK2	O00142	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CTAGE5	O15320	804 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	KPNA6	O60684	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	STAM2	O75886	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PGK1	P00558	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CFB	P00751	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	NR3C2	P08235	984 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SMPD1	P17405	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ACLY	P53396	1101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FGD1	P98174	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FUT2	Q10981	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	STXBP2	Q15833	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	KCNA10	Q16322	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RTN1	Q16799	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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