RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 GBP3Q9H0R5 595 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CCDC66A2RUB6 948 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 USP17L10C9JJH3 530 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 RAD21O60216 631 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SHMT1P34896 483 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CDK17Q00537 523 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 LRRC63Q05C16 580 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 GPS2Q13227 327 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ECM1Q16610 540 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TUBBP07437 444 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 GYS2P54840 703 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 DOK7Q18PE1 504 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 IQCDQ96DY2 449 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 UIMC1Q96RL1 719 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 VAV2P52735 878 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 HAS1Q92839 578 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 EP400Q96L91 3159 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ZNF263O14978 683 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB5O15062 677 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SLURP2P0DP57 97 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TSG101Q99816 390 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 DEF6Q9H4E7 631 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 JADE2Q9NQC1 790 aa22.74■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CAGE1Q8TC20 777 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 HLA-DOAP06340 250 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PSMD2Q13200 908 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 TMC4Q7Z404 712 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 CASP8Q14790 479 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 WDR93Q6P2C0 686 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 RRAGAQ7L523 313 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ZNF185O15231 689 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 USP14P54578 494 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 EHHADHQ08426 723 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 COASYQ13057 564 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 NEK11Q8NG66 645 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ABCB11O95342 1321 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ANO9A1A5B4 782 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 LRRC53A6NM62 1247 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 G3V3G9 751 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 KIF11P52732 1056 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 NFIAQ12857 509 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 PANK4Q9NVE7 773 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L15C9J2P7 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L11C9JVI0 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L18D6R9N7 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L22D6RA61 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L19D6RCP7 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L20D6RJB6 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 AKR1B10O60218 316 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L24Q0WX57 530 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TEKT1Q969V4 418 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-208ENST00000460766 TAF3Q5VWG9 929 aa22.69■■□□□ 1.22
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