RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TDP2	O95551	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP3A4	P08684	503 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CIITA	P33076	1130 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SREBF1	P36956	1147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	STAT2	P52630	851 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NFIA	Q12857	509 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DLGAP5	Q15398	846 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCE	Q6IPM2	695 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM83A	Q86UY5	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL6	Q8N841	843 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CSRNP1	Q96S65	589 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CPVL	Q9H3G5	476 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36	7e-6	■□□□□ 9.9
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC37A4	O43826	429 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD21	O60216	631 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFA10	O95299	355 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	IDE	P14735	1019 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TCP10	Q12799	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM6	Q14566	821 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SPA17	Q15506	151 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MEA1	Q16626	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	VWA3B	Q502W6	1294 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX12P	Q92771	950 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DNM3	Q9UQ16	869 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MYMK	A6NI61	221 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ERLIN1	O75477	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFB10	O96000	172 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	GAP43	P17677	238 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	RPA1	P27694	616 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF76	P36508	570 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EHHADH	Q08426	723 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	STK4	Q13043	487 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2S	Q16763	222 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	AOC3	Q16853	763 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1328	Q86T90	577 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK9	Q8TD19	979 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	PLIN2	Q99541	437 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC18	Q9H819	358 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC23	Q9UJX2	597 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC26	A0AVF1	554 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-222	ENST00000459758	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-222	ENST00000459758	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-222	ENST00000459758	POTEM	A6NI47	508 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms