RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427196.1

HCG25-218, Transcript of HLA complex group 25, humanhuman

TSL 2

Gene HCG25, Length 677 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG25-218ENST00000427196 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 KBTBD13C9JR72 458 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 CTDNEP1O95476 244 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 ALADP13716 330 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 SMARCA1P28370 1054 aa7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 ERVK-9P63128 1117 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 ERVK-24P63145 666 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 PPP2R5BQ15173 497 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 RAB30Q15771 203 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 TMEM240Q5SV17 173 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 MB21D1Q8N884 522 aa7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 PTPRSQ13332 1948 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 CPLX1O14810 134 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 ATP2A1O14983 1001 aa7.59□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 TRPV1Q8NER1 839 aa7.59□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG25-218ENST00000427196 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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HCG25-218ENST00000427196 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.58□□□□□ -1.2
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HCG25-218ENST00000427196 AMNQ9BXJ7 453 aa7.58□□□□□ -1.2
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HCG25-218ENST00000427196 SCN5AQ14524 2016 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 MCM3APO60318 1980 aa7.57□□□□□ -1.2
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HCG25-218ENST00000427196 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 OPLAHO14841 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 KIAA0355O15063 1070 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SCG2P13521 617 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CCNA1P78396 465 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ST3GAL2Q16842 350 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 WDR78Q5VTH9 848 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 ZNF365Q70YC5 407 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG25-218ENST00000427196 SPRED2Q7Z698 418 aa7.57□□□□□ -1.2
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