RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 PBX1P40424 430 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 TNFAIP1Q13829 316 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 TTI2Q6NXR4 508 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 TMEM139Q8IV31 216 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.57■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 H7C1D1 291 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 N4BP3O15049 544 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 TPM2P07951 284 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SEMA3FQ13275 785 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 MCTP2Q6DN12 878 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PIK3CDO00329 1044 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 DGKZQ13574 1117 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 DDX12PQ92771 950 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 HACL1Q9UJ83 578 aa26.56■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEB3A0JP26 581 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTECB2RU33 542 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 IDEP14735 1019 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SPAG1Q07617 926 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CEP135Q66GS9 1140 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEBQ6S5H4 581 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PTGER2P43116 358 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 KCND1Q9NSA2 647 aa26.55■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 FZD9O00144 591 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PTPN14Q15678 1187 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 Q4G0T1 1027 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 UNC13DQ70J99 1090 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 E9PMD0 336 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 INPP5BP32019 993 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 ZNF592Q92610 1267 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 P2RX5Q93086 422 aa26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 KCNJ6P48051 423 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 RBL2Q08999 1139 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 FAM160B2Q86V87 743 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 FEM1BQ9UK73 627 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 MED24O75448 989 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 UBXN2AP68543 259 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 HYIQ5T013 277 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.53■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 MSH4O15457 936 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CCNE1P24864 410 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 CIITAP33076 1130 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 ZNF76P36508 570 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.52■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEFA5A3E0 1075 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEIP0CG38 1075 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEGQ6S5H5 508 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 LDHDQ86WU2 507 aa26.51■■□□□ 1.84
LHX3-201ENST00000371746 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PLA2G6O60733 806 aa26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 POLR2MP0CAP2 368 aa26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TRAF1Q13077 416 aa26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 GLIS3Q8NEA6 775 aa26.51■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 THAP9Q9H5L6 903 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 TBX3O15119 743 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 GYPCP04921 128 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 BICDL2A1A5D9 508 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 ARHGAP6O43182 974 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CYP3A4P08684 503 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 PLA2G4BP0C869 781 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 CASP14P31944 242 aa26.49■■□□□ 1.83
LHX3-201ENST00000371746 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms