RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SCLYQ96I15 445 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT19A8MXV4 375 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RFPL3O75679 317 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SOD2P04179 222 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CYBBP04839 570 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NAT1P18440 290 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD3B2P26439 372 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MROH9Q5TGP6 573 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RPTNQ6XPR3 784 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CABP7Q86V35 215 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG1Q9BT22 464 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 JAM3Q9BX67 310 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 F8W031 263 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ARVCFO00192 962 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RASGRP1O95267 797 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 GRK2P25098 689 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 GRK3P35626 688 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PAK1Q13153 545 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NR1I3Q14994 352 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MLANAQ16655 118 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 BRAPQ7Z569 592 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF605Q86T29 641 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NETO2Q8NC67 525 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DIRC2Q96SL1 478 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FEZ1Q99689 392 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 IPPKQ9H8X2 491 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK12Q9HB15 430 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ABLIM1O14639 778 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SDSP20132 328 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPKAPK2P49137 400 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX11GQ96HA9 241 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ15Q99712 375 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 HRKO00198 91 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT9AO14904 365 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DGKIO75912 1065 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNA6P17658 529 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 VIPR1P32241 457 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A11P48066 632 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR5P85299 388 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NINJ1Q92982 152 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SGSM2O43147 1006 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX10O60683 326 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CKMP06732 381 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 GYS2P54840 703 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC14L1Q92503 715 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXW5Q969U6 566 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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