RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ADOQ96SZ5 270 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 MIPEPQ99797 713 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 PTPN18Q99952 460 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 GPR62Q9BZJ7 368 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF576Q9H609 170 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 RIOX1Q9H6W3 641 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 SYNPO2LQ9H987 977 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ELP3Q9H9T3 547 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 GPATCH2Q9NW75 528 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 MTMR4Q9NYA4 1195 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM13BQ9NYF5 915 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 MDFICQ9P1T7 246 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 CEP72Q9P209 647 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ACSL6Q9UKU0 697 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 UTRNP46939 3433 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 ARID1AO14497 2285 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 MYO15AQ9UKN7 3530 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 VPS13CQ709C8 3753 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC187A0A096LP49 1063 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM82A0PJX8 343 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 USP17L3A6NCW0 530 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 USP17L4A6NCW7 530 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CGB1A6NKQ9 187 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FADS2P1A8MWK0 482 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SMIM22K7EJ46 135 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 EREGO14944 169 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PEX11BO96011 259 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 C1RP00736 705 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GCP02774 474 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CYBBP04839 570 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ASGR2P07307 311 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DBHP09172 617 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NCAM1P13591 858 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TYRP1P17643 537 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 COMTP21964 271 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CYP7A1P22680 504 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 BRD2P25440 801 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 RPL10P27635 214 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PMLP29590 882 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 WEE1P30291 646 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 BMP8BP34820 402 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ARL4AP40617 200 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ZAP70P43403 619 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SEC13P55735 322 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP2CBP62714 309 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP2CAP67775 309 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CYP4F8P98187 520 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAAP100Q0VG06 881 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HYAL1Q12794 435 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FSTL1Q12841 308 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DUSP8Q13202 625 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 RAPGEF1Q13905 1077 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 KIR3DS1Q14943 382 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NR1I3Q14994 352 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.43e-38■■□□□ 13.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC14A2Q15849 920 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TCTN1Q2MV58 587 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 BBS9Q3SYG4 887 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MIDNQ504T8 468 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PPM1JQ5JR12 505 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DGKKQ5KSL6 1271 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LCE3EQ5T5B0 92 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PHF19Q5T6S3 580 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 STRIP1Q5VSL9 837 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 AGBL4Q5VU57 503 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MCTP2Q6DN12 878 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF425Q6IV72 752 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TCTN3Q6NUS6 607 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LETMD1Q6P1Q0 360 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GALNT18Q6P9A2 607 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LRFN4Q6PJG9 635 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 USP17L2Q6R6M4 530 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms