RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CCND2P30279 289 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PKN1Q16512 942 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL17Q6UXB2 119 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TLE2Q04725 743 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 STK3Q13188 491 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 BARHL2Q9NY43 387 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MRVI1Q9Y6F6 885 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ELP1O95163 1332 aa17.17■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SCG2P13521 617 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IFNAR1P17181 557 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PSMC6P62333 389 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP1Q07960 439 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 VTI1AQ96AJ9 217 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SLC26A6Q9BXS9 759 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PRO3102Q9H379 93 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GRIN2DO15399 1336 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS3O15072 1205 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ZEB2O60315 1214 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SORBS3O60504 671 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 GH1P01241 217 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 MYL3P08590 195 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CPT1AP50416 773 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 AK2P54819 239 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PURAQ00577 322 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SP2Q02086 613 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SEMA3FQ13275 785 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 AFG1LQ8WV93 481 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PGBD1Q96JS3 809 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SMCO2A6NFE2 343 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 A6NJR5 290 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ARVCFO00192 962 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MMP3P08254 477 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CDK7P50613 346 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ADCY7P51828 1080 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SCRN1Q12765 414 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 GDF15Q99988 308 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM260Q9NX78 707 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LTBP2Q14767 1821 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DTNBO60941 627 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CABYRO75952 493 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CLTBP09497 229 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FAAP100Q0VG06 881 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SLC43A3Q8NBI5 491 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LARGE1O95461 756 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 GGPS1O95749 300 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB8P26012 769 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ICAM3P32942 547 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ITGA7Q13683 1181 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FAM126BQ8IXS8 530 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TOX2Q96NM4 488 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ANO3Q9BYT9 981 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ESYT2A0FGR8 921 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CPLX1O14810 134 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.8 ms