RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 STARD7Q9NQZ5 370 aa31.05■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 BARHL2Q9NY43 387 aa31.05■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 AK2P54819 239 aa31.04■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 TPCN1Q9ULQ1 816 aa31.04■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS3O15072 1205 aa31.03■■■□□ 2.56
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TPGS1-201ENST00000359315 SCG2P13521 617 aa31.03■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 CCND2P30279 289 aa31.03■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R18Q6NYC8 613 aa31.03■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 SLC26A6Q9BXS9 759 aa31.03■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 DTNBO60941 627 aa31.02■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 IFNAR1P17181 557 aa31.02■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TPGS1-201ENST00000359315 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP1Q07960 439 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf53Q5VUE5 145 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PGBD1Q96JS3 809 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 GLT1D1Q96MS3 346 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 RIC8AQ9NPQ8 531 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.01■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 hCG_1984214I3L0E3 225 aa31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SCRN1Q12765 414 aa31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM260Q9NX78 707 aa31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 RTEL1Q9NZ71 1219 aa31■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SMCO2A6NFE2 343 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SORBS3O60504 671 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 LARGE1O95461 756 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 ADCY7P51828 1080 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PSMC6P62333 389 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 TLE2Q04725 743 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA6Q9UN73 950 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa30.99■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 ELP1O95163 1332 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA3FQ13275 785 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 CHRDL2Q6WN34 429 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 AFG1LQ8WV93 481 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 KIF2CQ99661 725 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN2DO15399 1336 aa30.98■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 GH1P01241 217 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 NEK4P51957 841 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SP2Q02086 613 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PCNX4Q63HM2 1172 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.97■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 PDLIM7Q9NR12 457 aa30.97■■■□□ 2.55
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TPGS1-201ENST00000359315 MYL3P08590 195 aa30.96■■■□□ 2.55
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TPGS1-201ENST00000359315 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
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TPGS1-201ENST00000359315 ZEB2O60315 1214 aa30.95■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 CLK2P49760 499 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
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TPGS1-201ENST00000359315 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
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TPGS1-201ENST00000359315 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.95■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.95■■■□□ 2.55
TPGS1-201ENST00000359315 CPLX1O14810 134 aa30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 PFKFB2O60825 505 aa30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 MMP3P08254 477 aa30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 AIFM3Q96NN9 605 aa30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ANO3Q9BYT9 981 aa30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ESYT2A0FGR8 921 aa30.93■■■□□ 2.54
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TPGS1-201ENST00000359315 ARVCFO00192 962 aa30.93■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ME3Q16798 604 aa30.93■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa30.93■■■□□ 2.54
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TPGS1-201ENST00000359315 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYND12Q9H0C1 365 aa30.93■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 PRO3102Q9H379 93 aa30.93■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.92■■■□□ 2.54
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TPGS1-201ENST00000359315 GGPS1O95749 300 aa30.92■■■□□ 2.54
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TPGS1-201ENST00000359315 ICAM3P32942 547 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA7Q13683 1181 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD1Q15327 319 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 SLC43A3Q8NBI5 491 aa30.92■■■□□ 2.54
TPGS1-201ENST00000359315 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.92■■■□□ 2.54
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