RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MTMR9Q96QG7 549 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TMX2Q9Y320 296 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 SLC37A4O43826 429 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ATP1A3P13637 1013 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CUL4BQ13620 913 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.8■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 H3BQF6 201 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MMP14P50281 582 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CALCRLQ16602 461 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CABP7Q86V35 215 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 AMNQ9BXJ7 453 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 FANCLQ9NW38 375 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.79■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PRELPP51888 382 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K10Q02779 954 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 MED15Q96RN5 788 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 WDR24Q96S15 920 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L15C9J2P7 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L11C9JVI0 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L18D6R9N7 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L22D6RA61 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L19D6RCP7 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L20D6RJB6 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM66O15016 1216 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CAP2P40123 477 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TECP42680 631 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP4BP1P59074 171 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L24Q0WX57 530 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO11Q86XK2 927 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 FAM71BQ8TC56 605 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PPM1EQ8WY54 764 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 GOPCQ9HD26 462 aa20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 EGFRP00533 1210 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TXKP42681 527 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC15Q8TF66 581 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 PLIN2Q99541 437 aa20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SPNS1-204ENST00000352260 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 RASA3Q14644 834 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 MED4Q9NPJ6 270 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 PLCG1P19174 1290 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 DPF2Q92785 391 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 FAM107BQ9H098 131 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.76■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 FZD9O00144 591 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 CPP00450 1065 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 USH1GQ495M9 461 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 MICALL2Q8IY33 904 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 ANO3Q9BYT9 981 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 CUEDC2Q9H467 287 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 CDC23Q9UJX2 597 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 L1RE1Q9UN81 338 aa20.75■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 MEIS2O14770 477 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC175P0C221 793 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF18P17022 549 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 GUCY2CP25092 1073 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 STAT2P52630 851 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 AP3B2Q13367 1082 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 VCPKMTQ9H867 229 aa20.74■□□□□ 0.91
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms