RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NBPF15Q8N660 670 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC45Q96CN5 670 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 THAP9Q9H5L6 903 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 MMEP08473 750 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KLRC1P26715 233 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TBC1D5Q92609 795 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 P2RX5Q93086 422 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 BMP15O95972 392 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 MAP3K12Q12852 859 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC37A3O60309 1634 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NWD1Q149M9 1564 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KIF3CO14782 793 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC38Q502W7 563 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TTI2Q6NXR4 508 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 HOOK2Q96ED9 719 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC14Q15048 493 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 XRCC4Q13426 336 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CCT6BQ92526 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 UIMC1Q96RL1 719 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 DISC1Q9NRI5 854 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CAND2O75155 1236 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PSMD2Q13200 908 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC41Q15345 812 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TATDN2Q93075 761 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SMIM24O75264 130 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PKN1Q16512 942 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NDST4Q9H3R1 872 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 MGRN1O60291 552 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CHN1P15882 459 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ADCY1Q08828 1119 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 RPS6KA1Q15418 735 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KLHL29Q96CT2 875 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KRIT1O00522 736 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NMT2O60551 498 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 COPB2P35606 906 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 TAF11Q15544 211 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CEP120Q8N960 986 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PSMD1Q99460 953 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ITGA6P23229 1130 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ERICH1Q86X53 443 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 RETREG2Q8NC44 543 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SLIT1O75093 1534 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PCK1P35558 622 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SOGA3Q5TF21 947 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF570Q96NI8 536 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 GREM2Q9H772 168 aa22.58■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SLC8A3P57103 927 aa22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 GRIK3Q13003 919 aa22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 INF2Q27J81 1249 aa22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.58■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 DAAM2Q86T65 1068 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 ESR2Q92731 530 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 SHBGP04278 402 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 CCNE1P24864 410 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 UBE3CQ15386 1083 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM4-201ENST00000330687 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms