RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBOAT7Q96N66 472 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM60Q9H2L4 133 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPREP23469 700 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPHP41219 470 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL31RAQ8NI17 732 aa31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM86B1E9PN63 330 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM86B2P0C5J1 330 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADORA2AP29274 412 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETQ01105 290 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G4DQ86XP0 818 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MXRA8Q9BRK3 442 aa31.06■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.05■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 VWA3AA6NCI4 1184 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPA6P17066 643 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSIG10LQ86VR7 867 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLFN12Q8IYM2 578 aa31.04■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOWAHBA6NEL2 793 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC15A5A6NIM6 579 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAM2O75886 525 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 STXBP2Q15833 593 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM266Q2M3C6 531 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 NIPA1Q7RTP0 329 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPP9Q86TI2 863 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLIC6Q96NY7 704 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTMR9Q96QG7 549 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC5A4Q9NY91 659 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQ27 194 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQ64 194 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQD8 194 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX3O15119 743 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPA1O75762 1119 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD3O95983 291 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXKP42681 527 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF8P60827 252 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE4DQ08499 809 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRB14Q14449 540 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2W1Q8TAV3 490 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF186Q9NXI6 227 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEIS1O00470 390 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D8O95759 1140 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRX1Q86UT6 975 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM20AQ96MK3 541 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB34Q9BZG1 259 aa31.02■■■□□ 2.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 LENG9Q96B70 501 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSRNP2Q9H175 543 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNMB3Q9NPA1 279 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 JADE2Q9NQC1 790 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB5P18084 799 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMA1P23946 247 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 LONP1P36776 959 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNPTABQ3T906 1256 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSIP1Q8NA03 581 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFHR5Q9BXR6 569 aa31■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB14A6NK59 587 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTMR1Q13613 665 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF22Q14807 665 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF792Q3KQV3 632 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM13BQ9NYF5 915 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHA12Q9UN75 941 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSH4O15457 936 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 TECP42680 631 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCGRTP55899 365 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRIN1Q05586 938 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAS1Q92839 578 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASTN1O14525 1302 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 COBLO75128 1261 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPRASP2Q96D09 838 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDHR1Q96JP9 859 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 UIMC1Q96RL1 719 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT12Q9BQG2 462 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXNB2O15031 1838 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAFGO15525 162 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAK2O60296 914 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 EDNRBP24530 442 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms