RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 MYMKA6NI61 221 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POLR2MP0CAP2 368 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 A0A1B0GTH6 734 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 ICAM1P05362 532 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 STAT3P40763 770 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 EXOC1Q9NV70 894 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 FZD1Q9UP38 647 aa22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 VCAM1P19320 739 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 EPS15P42566 896 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PDE4DQ08499 809 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 MSH4O15457 936 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 WRNIP1Q96S55 665 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SKILP12757 684 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 STK4Q13043 487 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 NR1I3Q14994 352 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POTEB3A0JP26 581 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POTECB2RU33 542 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 FCER1AP12319 257 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POTEBQ6S5H4 581 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 HOOK2Q96ED9 719 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 WDR18Q9BV38 432 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 VAV3Q9UKW4 847 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SLC26A4O43511 780 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 STIM1Q13586 685 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 UNC13DQ70J99 1090 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 FAM20AQ96MK3 541 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PSMA7O14818 248 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 MED24O75448 989 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PTPRAP18433 802 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SPP2Q13103 211 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 HPS3Q969F9 1004 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 FLOT1O75955 427 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF76P36508 570 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 HSD17B4P51659 736 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 USP14P54578 494 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 DYMQ7RTS9 669 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 RLFQ13129 1914 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 E9PMD0 336 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 NFIBO00712 420 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TEX33O43247 280 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 BACE1P56817 501 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 UBXN2AP68543 259 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 KRT31Q15323 416 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 TTI2Q6NXR4 508 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 DDX12PQ92771 950 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
UBXN6-201ENST00000301281 POTEFA5A3E0 1075 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 POTEIP0CG38 1075 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 EHHADHQ08426 723 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 POTEGQ6S5H5 508 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 KLRG1Q96E93 195 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 PICK1Q9NRD5 415 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 PBX1P40424 430 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-201ENST00000301281 GHRHRQ02643 423 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms