RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298231.5

PHOX2A-201, Transcript of paired like homeobox 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2A, Length 1,699 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2A-201ENST00000298231 MFAP3LO75121 409 aa29.55■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.55■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 TRIM47Q96LD4 638 aa29.55■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 STK24Q9Y6E0 443 aa29.55■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 TBX3O15119 743 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 RAD21O60216 631 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 FAM83AQ86UY5 434 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 LDHDQ86WU2 507 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 HAS1Q92839 578 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 P2RX5Q93086 422 aa29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 POTEIP0CG38 1075 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 POTEJP0CG39 1038 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 GOPCQ9HD26 462 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 KCNMB3Q9NPA1 279 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 A0A1W2PQC6 194 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 ZNF592Q92610 1267 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 CNTNAP1P78357 1384 aa29.53■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 POTEMA6NI47 508 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 LGALS16A8MUM7 142 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 MEIS2O14770 477 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 MARCH6O60337 910 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 ETF1P62495 437 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 PSMD2Q13200 908 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 SH2D4AQ9H788 454 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 TMX2Q9Y320 296 aa29.52■■■□□ 2.32
PHOX2A-201ENST00000298231 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 IRF2BP1Q8IU81 584 aa29.51■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 REXO1L1PQ8IX06 675 aa29.51■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 TAB2Q9NYJ8 693 aa29.51■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 C1QTNF8P60827 252 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 RBL2Q08999 1139 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 FSTL1Q12841 308 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L15C9J2P7 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L11C9JVI0 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L18D6R9N7 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L22D6RA61 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L19D6RCP7 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L20D6RJB6 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 PIK3CDO00329 1044 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 PLA2G6O60733 806 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 SREBF1P36956 1147 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 GOLGA8FQ08AF8 430 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L24Q0WX57 530 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 PTPN21Q16825 1174 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 Q4G0T1 1027 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 USP17L6PQ6QN14 398 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.5■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 TRIM49BA6NDI0 452 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 GYPCP04921 128 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 STAT2P52630 851 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 ARHGAP4P98171 946 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 MCM6Q14566 821 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.49■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 ABCB11O95342 1321 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 MYMKA6NI61 221 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 PMS1P54277 932 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 JAG1P78504 1218 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CHADLQ6NUI6 762 aa29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 A0A1W2PRG0 241 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CIITAP33076 1130 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 STK4Q13043 487 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 IQCDQ96DY2 449 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 VPS16Q9H269 839 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CLRN2A0PK11 232 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 EGFRP00533 1210 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CCDC175P0C221 793 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 DNM2P50570 870 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 EHHADHQ08426 723 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 CENPPQ6IPU0 288 aa29.47■■■□□ 2.31
PHOX2A-201ENST00000298231 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms