RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25-201ENST00000293861 PBX1P40424 430 aa24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM6Q14566 821 aa24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCB11O95342 1321 aa24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25-201ENST00000293861 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC174Q6PII3 467 aa24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 UNC13DQ70J99 1090 aa24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 LENG9Q96B70 501 aa24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 MYMKA6NI61 221 aa24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM20AQ96MK3 541 aa24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 SBF1O95248 1867 aa24.06■■□□□ 1.44
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SNRNP25-201ENST00000293861 POLR2MP0CAP2 368 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT31Q15323 416 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ECM1Q16610 540 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 THAP9Q9H5L6 903 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 STK24Q9Y6E0 443 aa24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TEX33O43247 280 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CCNE1P24864 410 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 INPP5BP32019 993 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 USP14P54578 494 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 STK4Q13043 487 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PRR16Q569H4 304 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TTI2Q6NXR4 508 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ILDR2Q71H61 639 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNK18Q7Z418 384 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 GJA10Q969M2 543 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PARP14Q460N5 1801 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 BICDL2A1A5D9 508 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNJ18B7U540 433 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM86B1E9PN63 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ICAM1P05362 532 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TPM2P07951 284 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNJ12Q14500 433 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 LDHDQ86WU2 507 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR18Q9BV38 432 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TC2NQ8N9U0 490 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 P2RX5Q93086 422 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 COBLO75128 1261 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CFBP00751 764 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 EHHADHQ08426 723 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMD2Q13200 908 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPN21Q16825 1174 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 GGA3Q9NZ52 723 aa24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM139Q8IV31 216 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 USP27XA6NNY8 438 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FCER1AP12319 257 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 ERMNQ8TAM6 284 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX12PQ92771 950 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM47Q96LD4 638 aa24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.02■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 EPS15P42566 896 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 WRNIP1Q96S55 665 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PICK1Q9NRD5 415 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 PNMA2Q9UL42 364 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF536O15090 1300 aa24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 N4BP3O15049 544 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MSH4O15457 936 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 STX10O60499 249 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR2Q13614 643 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D5Q92609 795 aa24■■□□□ 1.43
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP6O43182 974 aa24■■□□□ 1.43
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