RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.19■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 PXMP2Q9NR77 195 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 ARIH2O95376 493 aa24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.18■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 NR3C2P08235 984 aa24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 POLR2MP0CAP2 368 aa24.18■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 TMEM199Q8N511 208 aa24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.18■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 A6NJR5 290 aa24.16■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.16■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 MICU3Q86XE3 530 aa24.16■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 HIPK3Q9H422 1215 aa24.16■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 B4GALT4O60513 344 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 REC8O95072 547 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 GH1P01241 217 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 HSPA4P34932 840 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 KCNB2Q92953 911 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 CSF2RAP15509 400 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 APOA5Q6Q788 366 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 AFG1LQ8WV93 481 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.14■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 MYO9BQ13459 2157 aa24.13■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 PGM5Q15124 567 aa24.13■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.13■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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CITED1-201ENST00000246139 CPA1P15085 419 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 CCL23P55773 120 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 FGD1P98174 961 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP1Q07960 439 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 GRIN2CQ14957 1233 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.11■■□□□ 1.45
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CITED1-201ENST00000246139 IL31RAQ8NI17 732 aa24.11■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 CUL5Q93034 780 aa24.11■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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CITED1-201ENST00000246139 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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CITED1-201ENST00000246139 CYP2C9P11712 490 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 FOSL2P15408 326 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 DNAJB2P25686 324 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 LAMC2Q13753 1193 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 RTN1Q16799 776 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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CITED1-201ENST00000246139 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 TMEM240Q5SV17 173 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 ZNF365Q70YC5 407 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-201ENST00000246139 IL23AQ9NPF7 189 aa24.09■■□□□ 1.45
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