RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 MAN2A1Q16706 1144 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.29■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 STK4Q13043 487 aa25.28■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.28■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 MECOMQ03112 1051 aa25.28■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.27■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 BARHL2Q9NY43 387 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 OR52Z1P0C646 297 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 LIG3P49916 1009 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54-201ENST00000215941 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 NDUFAB1O14561 156 aa25.26■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 INF2Q27J81 1249 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.26■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.25■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 FSBPO95073 299 aa25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP58Q5T655 872 aa25.25■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 PNMA1Q8ND90 353 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 KAT2BQ92831 832 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 DRC1Q96MC2 740 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 STXBP3O00186 592 aa25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC7A5Q01650 507 aa25.24■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.24■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 FCER1AP12319 257 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ANKRD54-201ENST00000215941 PDXDC1Q6P996 788 aa25.22■■□□□ 1.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.22■■□□□ 1.63
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