RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639496.1

KCNQ3-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, human

TSL 5

Gene KCNQ3, Length 4,943 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPATA1	Q5VX52	437 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PIGS	Q96S52	555 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PSMB7	Q99436	277 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT12	Q99456	494 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	NR2F2	P24468	414 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	NFKBIA	P25963	317 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	BFSP1	Q12934	665 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MYL1	P05976	194 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	TTC1	Q99614	292 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MYL7	Q01449	175 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	ALCAM	Q13740	583 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM167A	Q96KS9	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	IFNAR1	P17181	557 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	MECOM	Q03112	1051 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDKL2	Q92772	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KCNQ3-208	ENST00000639496	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	ADCY8	P40145	1251 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDK8	P49336	464 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496		A0A1W2PQ27	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496		A0A1W2PQ64	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496		A0A1W2PQD8	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	THAP12	O43422	761 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	GH2	P01242	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	CYP21A2	P08686	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANXA13	P27216	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	LMNB2	Q03252	620 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	MED7	O43513	233 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496		K7ERI5	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	KCNK3	O14649	394 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KCNQ3-208	ENST00000639496	LIFR	P42702	1097 aa		11.2	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms