RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637848.1

EFR3A-208, Transcript of EFR3 homolog A, human

TSL 5 BASIC

Gene EFR3A, Length 2,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFR3A-208	ENST00000637848	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	STXBP3	O00186	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ENC1	O14682	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TRIM66	O15016	1216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	NRDC	O43847	1150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CALM1	P0DP23	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CALM2	P0DP24	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CALM3	P0DP25	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	NPR1	P16066	1061 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	STAT6	P42226	847 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	BTD	P43251	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	GSTO1	P78417	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	STK4	Q13043	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TERF2	Q15554	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PIGS	Q96S52	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PNKP	Q96T60	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	FLT1	P17948	1338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC175	P0C221	793 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PLCG1	P19174	1290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	KRT9	P35527	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PDE6B	P35913	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	TEC	P42680	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CDK8	P49336	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	UBXN1	Q04323	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PAK1	Q13153	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PICALM	Q13492	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	GRM4	Q14833	912 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	COA7	Q96BR5	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EFR3A-208	ENST00000637848	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.59	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	GAK	O14976	1311 aa		4.59	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848		B4DLN1	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	CREB3	O43889	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	BAG3	O95817	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	PPP4C	P60510	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	PMM1	Q92871	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	EYA3	Q99504	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EFR3A-208	ENST00000637848	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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