RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 CD320Q9NPF0 282 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 CALML3P27482 149 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLC16A2P36021 539 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 SCFD2Q8WU76 684 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 DCAF4Q8WV16 495 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
UBE2C-208ENST00000617055 PDE4DQ08499 809 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 PTGISQ16647 500 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 COPS5Q92905 334 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CHMP4BP1P59074 171 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CAGE1Q8TC20 777 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 INCENPQ9NQS7 918 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SIP14410 1827 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 EDNRBP24530 442 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 NOVP48745 357 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 DEFB103AP81534 67 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 GPNMBQ14956 572 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 PRR33A8MZF0 331 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SELPP16109 830 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ERVK-21P61565 698 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 DNERQ8NFT8 737 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ARIH2O95376 493 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 SESTD1Q86VW0 696 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 GJD3Q8N144 294 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 RAD9AQ99638 391 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 PNMA2Q9UL42 364 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 LINC01553A4QN01 128 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 FOXP2O15409 715 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 GJB5O95377 273 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 CXCL10P02778 98 aa21.33■■□□□ 1.01
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UBE2C-208ENST00000617055 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 FSD1Q9BTV5 496 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-208ENST00000617055 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 B4DLN1 442 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 NBNO60934 754 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 RBL2Q08999 1139 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 AFG1LQ8WV93 481 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 DCTPP1Q9H773 170 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.32■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 ORC4O43929 436 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 MMP3P08254 477 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CKBP12277 381 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TCTN1Q2MV58 587 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CRBNQ96SW2 442 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.31■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 EFCAB14O75071 495 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 ALADP13716 330 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 IL9P15248 144 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 KAT2BQ92831 832 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 UIMC1Q96RL1 719 aa21.3■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.29■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 GH1P01241 217 aa21.29■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 PDHBP11177 359 aa21.29■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGAP1Q07960 439 aa21.29■■□□□ 1
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