RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQ27 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQ64 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQD8 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 H0Y626 953 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM16O95361 564 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB7P09629 217 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 DEFA1P59665 94 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 DEFA3P59666 94 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PANX2Q96RD6 677 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 STMN3Q9NZ72 180 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SNX1Q13596 522 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ZMYM6O95789 1325 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NR1D1P20393 614 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 LCA5Q86VQ0 697 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 MYCT1Q8N699 235 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 USTQ9Y2C2 406 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PFKFB1P16118 471 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PTPREP23469 700 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PDE6CP51160 858 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 COPS6Q7L5N1 327 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL29Q96CT2 875 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC11Q96DB2 347 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SCYL1Q96KG9 808 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ADCY2Q08462 1091 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TEX11Q8IYF3 940 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SUN2Q9UH99 717 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 MYL1P05976 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ACTN1P12814 892 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 DRP2Q13474 957 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 EFHBQ8N7U6 833 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NOD1Q9Y239 953 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CASP14P31944 242 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 HORMAD1Q86X24 394 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 EXOC3O60645 756 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TERF2Q15554 542 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 KAZNQ674X7 775 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 POLE2P56282 527 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TERB1Q8NA31 727 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRT-209ENST00000612229 GPC4O75487 556 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFB4P59827 614 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 RXRAP19793 462 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TSPY1Q01534 308 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 B4E1Z4 1266 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 RFC4P35249 363 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 PLS1Q14651 629 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TTC6Q86TZ1 520 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP3Q96P20 1036 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NPATQ14207 1427 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 STX3Q13277 289 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TNNI3KQ59H18 835 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 FSCBQ5H9T9 825 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT3Q9UH03 358 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-209ENST00000612229 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.54□□□□□ -1.2
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