RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT7AO00755 349 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2A1O14983 1001 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CIITAP33076 1130 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 COPB2P35606 906 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TPM4P67936 248 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GHRHRQ02643 423 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 POSTNQ15063 836 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 LONRF3Q496Y0 759 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SPECC1Q5M775 1068 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT79Q5XKE5 535 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CPXCR1Q8N123 301 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ERMNQ8TAM6 284 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCE1Q969G3 411 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX58Q96C10 678 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR9Q96QG7 549 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TXKP42681 527 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD17B4P51659 736 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 AMPD3Q01432 767 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CABP7Q86V35 215 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEDQ86YR6 584 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PDILTQ8N807 584 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 OTUD5Q96G74 571 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 EPSTI1Q96J88 318 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 MBOAT7Q96N66 472 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RBSNQ9H1K0 784 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 TDP2O95551 362 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPP22059 807 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIN1Q05586 938 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RMND1Q9NWS8 449 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO40Q9UH90 709 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 TECP42680 631 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP12P59046 1061 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CHADLQ6NUI6 762 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ATG4CQ96DT6 458 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 DISC1Q9NRI5 854 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CREBZFQ9NS37 354 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 FZD1Q9UP38 647 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF536O15090 1300 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 BECN2A8MW95 431 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAPC2Q13487 334 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA3Q9UL41 463 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 OPLAHO14841 1288 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF165P49910 485 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CHST13Q8NET6 341 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PANK2Q9BZ23 570 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF146Q9NTX7 359 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 STK17AQ9UEE5 414 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 SMTNL1A8MU46 457 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC37A4O43826 429 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 IL17AQ16552 155 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR16Q569H4 304 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF214Q8ND24 703 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 OPTNQ96CV9 577 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 GSDMAQ96QA5 445 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ACAD9Q9H845 621 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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