RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	UBOX5	O94941	541 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF205	O95201	554 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM200B	P0CF97	657 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	VDR	P11473	427 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	C6	P13671	934 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TACR2	P21452	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	BMP8B	P34820	402 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PEX19	P40855	299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PDILT	Q8N807	584 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	LOXL4	Q96JB6	756 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MRI	Q9BWK5	157 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CHST7	Q9NS84	486 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC189	A1A4V9	331 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CBFA2T2	O43439	604 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJA2	O60884	412 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	F13A1	P00488	732 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	NCAM1	P13591	858 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ATF2	P15336	505 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	RAG1	P15918	1043 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MVK	Q03426	396 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	BIRC2	Q13490	618 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	C8orf49	Q96NF6	230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	JMJD8	Q96S16	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468		A0A1W2PQJ5	194 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TLDC2	A0PJX2	215 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PLAT	P00750	562 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PF4	P02776	101 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DBH	P09172	617 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	VAV1	P15498	845 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ACVRL1	P37023	503 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SATB1	Q01826	763 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	RGL3	Q3MIN7	710 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ARSH	Q5FYA8	562 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SDE2	Q6IQ49	451 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PRR13	Q9NZ81	148 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SLPI	P03973	132 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CCNF	P41002	786 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TDO2	P48775	406 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	TBX4	P57082	545 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	PRR5	P85299	388 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	MPP2	Q14168	576 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PTPRM-204	ENST00000577468	USP51	Q70EK9	711 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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