RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 IWS1Q96ST2 819 aa26.13■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 SENP2Q9HC62 589 aa26.13■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 COL20A1Q9P218 1284 aa26.13■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 COL6A3P12111 3177 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 STXBP2Q15833 593 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 TRAF1Q13077 416 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 HOMER1Q86YM7 354 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 COPS5Q92905 334 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 TRPV6Q9H1D0 765 aa26.11■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 KPNA6O60684 536 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CSF2RAP15509 400 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CYP2C18P33260 490 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 TROAPQ12815 778 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 FAM161BQ96MY7 647 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 HIPK3Q9H422 1215 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.1■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 A6NJR5 290 aa26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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CLN3-215ENST00000565236 ANTXR2P58335 489 aa26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 PIGSQ96S52 555 aa26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.09■■□□□ 1.77
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CLN3-215ENST00000565236 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 OPLAHO14841 1288 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 B4GALT4O60513 344 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 ARIH2O95376 493 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 HSD17B4P51659 736 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 CASC1Q6TDU7 716 aa26.08■■□□□ 1.77
CLN3-215ENST00000565236 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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CLN3-215ENST00000565236 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.07■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 NR3C2P08235 984 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 SAMD3Q8N6K7 520 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 GH1P01241 217 aa26.06■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.06■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 PRC1O43663 620 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 CYTH3O43739 400 aa26.05■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 MCM5P33992 734 aa26.05■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 LY9Q9HBG7 655 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 IL23AQ9NPF7 189 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.05■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF365Q70YC5 407 aa26.04■■□□□ 1.76
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CLN3-215ENST00000565236 GUCD1Q96NT3 240 aa26.04■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 MAP3K14Q99558 947 aa26.04■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 DDAH1O94760 285 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 KIF5BP33176 963 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 CCL23P55773 120 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 SKAP1Q86WV1 359 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 TMEM87BQ96K49 555 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.03■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 CCDC69A6NI79 296 aa26.02■■□□□ 1.76
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