RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCN4AP35499 1836 aa22.71■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVK-24P63145 666 aa22.7■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.7■■□□□ 1.23
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.7■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.69■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.69■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 PNKPQ96T60 521 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 MED4Q9NPJ6 270 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 RHOBTB3O94955 611 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTDP43251 543 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 MICALL2Q8IY33 904 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CERS5Q8N5B7 392 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEIP0CG38 1075 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEJP0CG39 1038 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPHX2P34913 555 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK8P49336 464 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT9P35527 623 aa22.67■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NAPAP54920 295 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 STIM1Q13586 685 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PLIN2Q99541 437 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUEDC2Q9H467 287 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 THAP9Q9H5L6 903 aa22.67■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FLT1P17948 1338 aa22.66■■□□□ 1.22
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CCNDBP1-205ENST00000564630 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC15Q8TF66 581 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMLQ99445 158 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 LGALS16A8MUM7 142 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 F8W031 263 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMA7O14818 248 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 MB21D1Q8N884 522 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPVLQ9H3G5 476 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCB6Q9NP58 842 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR52Z1P0C646 297 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 CABP7Q86V35 215 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 TEX11Q8IYF3 940 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS18Q9P253 973 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PQC6 194 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 VGLL3A8MV65 326 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 EGFRP00533 1210 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMPD2Q01433 879 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC35F6Q8N357 371 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf50Q9HD87 102 aa22.64■■□□□ 1.22
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMCO2A6NFE2 343 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLCG1P19174 1290 aa22.64■■□□□ 1.21
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNA11P29992 359 aa22.64■■□□□ 1.21
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