RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	EBF1	Q9UH73	591 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PLXNC1	O60486	1568 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	TLDC2	A0PJX2	215 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC12	P31275	282 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SEPHS1	P49903	392 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	HK2	P52789	917 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	NSMF	Q6X4W1	530 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CDC6	Q99741	560 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	DLX3	O60479	287 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	GFRA1	P56159	465 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SQSTM1	Q13501	440 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf27A	Q580R0	203 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	NAT16	Q8N8M0	369 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	OSBP2	Q969R2	916 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC2	Q96KP1	924 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC1B	Q9P126	229 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TBX22	Q9Y458	520 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ABCA6	Q8N139	1617 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PZP	P20742	1482 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	BLACE	A4D250	179 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	THBD	P07204	575 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PLS3	P13797	630 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ERVFC1	P60507	584 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	COPS5	Q92905	334 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ARNTL	O00327	626 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR1	P11362	822 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KANK1	Q14678	1352 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CP	P00450	1065 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SCG5	P05408	212 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LINS1-210	ENST00000560934	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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