RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 CFBP00751 764 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 WTAPQ15007 396 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 COPS5Q92905 334 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 GUCD1Q96NT3 240 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.27■■□□□ 1.64
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB5O15062 677 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 ACRP10323 421 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 STXBP2Q15833 593 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CHST3Q7LGC8 479 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 HOMER1Q86YM7 354 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 IWS1Q96ST2 819 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 COL20A1Q9P218 1284 aa25.26■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 KPNA6O60684 536 aa25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TMEM240Q5SV17 173 aa25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 ARIH2O95376 493 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CCL23P55773 120 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 GRM4Q14833 912 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 MAP4K1Q92918 833 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 IL23AQ9NPF7 189 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.24■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CHMP4BP1P59074 171 aa25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TRAF1Q13077 416 aa25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 ZNF365Q70YC5 407 aa25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 COL6A3P12111 3177 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 A6NJR5 290 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 LY6KQ17RY6 165 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 MTMR8Q96EF0 704 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 SENP2Q9HC62 589 aa25.22■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 GH1P01241 217 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 FGBP02675 491 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 DNAJB2P25686 324 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PIGSQ96S52 555 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 PXMP2Q9NR77 195 aa25.21■■□□□ 1.63
CIPC-208ENST00000557115 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.2■■□□□ 1.62
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CIPC-208ENST00000557115 NR3C2P08235 984 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 CYP2C9P11712 490 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 HSD17B4P51659 736 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 CASC1Q6TDU7 716 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 AFG1LQ8WV93 481 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 TROAPQ12815 778 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 NOD1Q9Y239 953 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.19■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 OPLAHO14841 1288 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 POLR2MP0CAP2 368 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MYLIPQ8WY64 445 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 HERVK_113Q902F9 699 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 TIFAQ96CG3 184 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 SCLYQ96I15 445 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.18■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 MMP3P08254 477 aa25.17■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 ANTXR2P58335 489 aa25.17■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.17■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 CYTH3O43739 400 aa25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 KIF5BP33176 963 aa25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP1Q07960 439 aa25.16■■□□□ 1.62
CIPC-208ENST00000557115 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.16■■□□□ 1.62
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