RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC24	Q50LG9	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	METTL24	Q5JXM2	366 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS37D	Q86XT2	251 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SIX5	Q8N196	739 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MEIS3	Q99687	375 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	THEG	Q9P2T0	379 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH23	Q9H251	3354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PRR19	A6NJB7	356 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SRGAP3	O43295	1099 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ADCY3	O60266	1144 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MICAL2	O94851	1124 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXD10	P28358	340 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MCM6	Q14566	821 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF43	Q68DV7	783 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	KAZALD1	Q96I82	304 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	OTOF	Q9HC10	1997 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CLRN2	A0PK11	232 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994		F8W031	263 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP9B	O43861	1147 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	RLBP1	P12271	317 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	GYG1	P46976	350 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	GTF2A2	P52657	109 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SEC13	P55735	322 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SHH	Q15465	462 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49	1e-11	■■■■□ 25.2
ATXN3-231	ENST00000554994	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PPME1	Q9Y570	386 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	UTY	O14607	1347 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	PFAS	O15067	1338 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	POM121C	A8CG34	1229 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR64	B1ANS9	1081 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	EYA2	O00167	538 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	MMP20	O60882	483 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	XYLB	O75191	536 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	KLRK1	P26718	216 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	FLT3LG	P49771	235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	NHLH1	Q02575	133 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf99	Q6UX52	265 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49

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