RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552211.5

NCKAP1L-208, Transcript of NCK associated protein 1 like, human

TSL 5

Gene NCKAP1L, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GNAT2	P19087	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PDE4B	Q07343	736 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NEDD4	P46934	1319 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NBN	O60934	754 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PDHB	P11177	359 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EDNRB	P24530	442 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	USH1G	Q495M9	461 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211		Q9Y3F1	56 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.96	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FGR	P09769	529 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MS4A1	P11836	297 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211		A6NJR5	290 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ORC4	O43929	436 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZEB2	O60315	1214 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FGA	P02671	866 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MMP3	P08254	477 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FDX1	P10109	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MX1	P20591	662 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PDE4D	Q08499	809 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PTGIS	Q16647	500 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.93	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	OPLAH	O14841	1288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CPT1A	P50416	773 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TRIO	O75962	3097 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	LGR5	O75473	907 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RGS20	O76081	388 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IL9	P15248	144 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HLA-C	Q95604	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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