RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	SMARCA1	P28370	1054 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	FANCB	Q8NB91	859 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PXMP2	Q9NR77	195 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996		Q9Y3F1	56 aa		24.18	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CALM1	P0DP23	149 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CALM2	P0DP24	149 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CALM3	P0DP25	149 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	GNAQ	P50148	359 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	POTED	Q86YR6	584 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	COPS5	Q92905	334 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		24.17	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	IL31RA	Q8NI17	732 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	SCFD2	Q8WU76	684 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	IWS1	Q96ST2	819 aa		24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	ELP1	O95163	1332 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	NR3C2	P08235	984 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PPP2R5B	Q15173	497 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		24.15	■■□□□ 1.46
CS-222	ENST00000550996	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	POLR2M	P0CAP2	368 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	BMP8B	P34820	402 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	CDK7	P50613	346 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	FUT2	Q10981	343 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	TRAF1	Q13077	416 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	USP26	Q9BXU7	913 aa		24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	24.14	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	GRIN2D	O15399	1336 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996		B4DLN1	442 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	ITGB8	P26012	769 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	STXBP2	Q15833	593 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		24.13	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	ZBTB43	O43298	467 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	RGS20	O76081	388 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	RPS6KB1	P23443	525 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	FAAP100	Q0VG06	881 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996		Q6ZUG5	572 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	ARVCF	O00192	962 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	CLTB	P09497	229 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	CDC27	P30260	824 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	APOBR	Q0VD83	1088 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	TTLL4	Q14679	1199 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	PGM5	Q15124	567 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	RTN1	Q16799	776 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	LY6K	Q17RY6	165 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	TOX2	Q96NM4	488 aa		24.11	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	MEIS2	O14770	477 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	PSMC6	P62333	389 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	BRF1	Q92994	677 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	24.1	■■□□□ 1.45
CS-222	ENST00000550996	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		24.1	■■□□□ 1.45

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