RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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PTPRB-208ENST00000550358 PSMC4P43686 418 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 VPS18Q9P253 973 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRB-208ENST00000550358 H2AFZP0C0S5 128 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRB-208ENST00000550358 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 AP3M2P53677 418 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 PTH1RQ03431 593 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 PNOCQ13519 176 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 MYL10Q9BUA6 226 aa9.28□□□□□ -0.92
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