RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550325.5

VDR-208, Transcript of vitamin D receptor, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VDR, Length 3,925 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VDR-208	ENST00000550325	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	FCER1A	P12319	257 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	HSD17B3	P37058	310 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	IFNAR2	P48551	515 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	TNNC1	P63316	161 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	IL17A	Q16552	155 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	UPP2	O95045	317 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	GREM2	Q9H772	168 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ESR2	Q92731	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	P2RX5	Q93086	422 aa		13.35	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PKN1	Q16512	942 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	HLF	Q16534	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	LPIN2	Q92539	896 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.34	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	STK4	Q13043	487 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DRP2	Q13474	957 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
VDR-208	ENST00000550325	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	CUL5	Q93034	780 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	ANP32D	O95626	131 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	KCNB1	Q14721	858 aa		13.33	□□□□□ -0.28
VDR-208	ENST00000550325	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28

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