RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 KCNQ5Q9NR82 932 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 UBP1Q9NZI7 540 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 REV1Q9UBZ9 1251 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 CPS1P31327 1500 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 ACEP12821 1306 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 FITM1A5D6W6 292 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 INHBBP09529 407 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 TEKQ02763 1124 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 NR0B2Q15466 257 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 PIK3R4Q99570 1358 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 GRIN3BO60391 1043 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 BCAR3O75815 825 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 GALK1P51570 392 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF605Q86T29 641 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 PTCH1Q13635 1447 aa6.98□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 C3P01024 1663 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 HTR3BO95264 441 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 DLG4P78352 724 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 APOBRQ0VD83 1088 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 SHISA4Q96DD7 197 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 VWCEQ96DN2 955 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 ASPNQ9BXN1 380 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 GPR160Q9UJ42 338 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 NCANO14594 1321 aa6.97□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 KIF2CQ99661 725 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 TINF2Q9BSI4 451 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 USP6P35125 1406 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 NOTOA8MTQ0 251 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 PRRG2O14669 202 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 PEX10O60683 326 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 PRKAR2BP31323 418 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 GJA8P48165 433 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 MPP2Q14168 576 aa6.95□□□□□ -1.3
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TRDN-205ENST00000546248 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.95□□□□□ -1.3
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TRDN-205ENST00000546248 SGPP1Q9BX95 441 aa6.95□□□□□ -1.3
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TRDN-205ENST00000546248 ADGRB2O60241 1585 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 B8ZZF3 427 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 SEMA7AO75326 666 aa6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-205ENST00000546248 MCM4P33991 863 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 PDE6BP35913 854 aa6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-205ENST00000546248 DUSP4Q13115 394 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 NFE2L2Q16236 605 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-205ENST00000546248 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.94□□□□□ -1.3
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