RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545964.1

MDM1-215, Transcript of Mdm1 nuclear protein, human

TSL 2

Gene MDM1, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM1-215	ENST00000545964	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ASNS	P08243	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SKI	P12755	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TRIM27	P14373	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CAPN2	P17655	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CYP7A1	P22680	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CNGA1	P29973	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZAP70	P43403	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP5	P45974	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MTX1	Q13505	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GH2	P01242	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MAPK4	P31152	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GRIK1	P39086	918 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	HERVK_113	P62684	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CCL14	Q16627	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TRIB2	Q92519	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FEZ1	Q99689	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PORCN	Q9H237	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SSTR4	P31391	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	RGS2	P41220	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SMTN	P53814	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GDF10	P55107	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ERVK-24	P63145	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	CCNA1	P78396	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964		Q7L0L9	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM1-215	ENST00000545964	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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