RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM160B2Q86V87 743 aa22.56■■□□□ 1.2
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CD27-AS1-208ENST00000538616 VWCEQ96DN2 955 aa22.56■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.56■■□□□ 1.2
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CD27-AS1-208ENST00000538616 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
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CD27-AS1-208ENST00000538616 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.54■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2G6O60733 806 aa22.53■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDHBP11177 359 aa22.53■■□□□ 1.2
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CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT23Q9C075 422 aa22.53■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.53■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF536O15090 1300 aa22.53■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRB10Q13322 594 aa22.52■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.52■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.52■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 DGKHQ86XP1 1220 aa22.52■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.52■■□□□ 1.2
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.51■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP4K1Q92918 833 aa22.51■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.51■■□□□ 1.19
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CD27-AS1-208ENST00000538616 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 PITPNM1O00562 1244 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNHG28P0DPA3 235 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALAS1P13196 640 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALADP13716 330 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 RETREG2Q8NC44 543 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKS1AQ92625 1134 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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CD27-AS1-208ENST00000538616 KAT14Q9H8E8 782 aa22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 E7EWF7 191 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAIAP3O94812 1187 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 NT5C2P49902 561 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRE11P49959 708 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 GJD3Q8N144 294 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNH6Q9H252 994 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 VTA1Q9NP79 307 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD320Q9NPF0 282 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF146Q9NTX7 359 aa22.48■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPXNO60711 386 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRDNQ13061 729 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHST3Q7LGC8 479 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.47■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQCF3P0C7M6 154 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPT1AP50416 773 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC23AQ15436 765 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.46■■□□□ 1.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.46■■□□□ 1.19
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