RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBX21	Q9UL17	535 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARVCF	O00192	962 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFB	P00751	764 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	RXRA	P19793	462 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	RMDN3	Q96TC7	470 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PXMP2	Q9NR77	195 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD4	P01730	458 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMARCA1	P28370	1054 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHB4	P54760	987 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMTC2	Q8N394	836 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL31RA	Q8NI17	732 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCFD2	Q8WU76	684 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK1	Q96PY6	1258 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	IWS1	Q96ST2	819 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		14.74	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL6A3	P12111	3177 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH23	Q9H251	3354 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS20	O76081	388 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMC6	P62333	389 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP2R5B	Q15173	497 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		14.73	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC69	A6NI79	296 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NJR5	290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CABYR	O75952	493 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR3C2	P08235	984 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF5B	P33176	963 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP1	Q07960	439 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGA7	Q13683	1181 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTLL4	Q14679	1199 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	STXBP2	Q15833	593 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6K	Q17RY6	165 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF20	Q5VTR2	975 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014		B4DLN1	442 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPA1	P15085	419 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPA4	P34932	840 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUT2	Q10981	343 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGM5	Q15124	567 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHH	Q15465	462 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOA5	Q6Q788	366 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	FANCB	Q8NB91	859 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SH3BP2-222	ENST00000512014	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEIS2	O14770	477 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZEB2	O60315	1214 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMP1	P01033	207 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEFL	P07196	543 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2M	P0CAP2	368 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAG1	P15918	1043 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNAQ	P50148	359 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPT1A	P50416	773 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	MICU3	Q86XE3	530 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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