RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	MTA3	Q9BTC8	594 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	CABYR	O75952	493 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	HSD17B4	P51659	736 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	PPP2R5B	Q15173	497 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	COPS5	Q92905	334 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	TBX21	Q9UL17	535 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	GRIN2D	O15399	1336 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	ARIH2	O95376	493 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	GHRHR	Q02643	423 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	SHH	Q15465	462 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM87B	Q96K49	555 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	PSMC6	P62333	389 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	ITGA7	Q13683	1181 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MIB2-215	ENST00000502470	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		31.45	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	31.44	■■■□□ 2.62	1e-6	■■□□□ 11.6
MIB2-215	ENST00000502470	CDC45	O75419	566 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	DDAH1	O94760	285 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	IWS1	Q96ST2	819 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	MAP3K14	Q99558	947 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PXMP2	Q9NR77	195 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	CD4	P01730	458 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	CPT1A	P50416	773 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	EPHB4	P54760	987 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TTLL4	Q14679	1199 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TIMP1	P01033	207 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	STXBP2	Q15833	593 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	GPR153	Q6NV75	609 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC69	A6NI79	296 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	MYL3	P08590	195 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	FPGS	Q05932	587 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TMTC2	Q8N394	836 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	NR3C2	P08235	984 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	RXRA	P19793	462 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	LIFR	P42702	1097 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	TRAF1	Q13077	416 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	RNF20	Q5VTR2	975 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470		A6NJR5	290 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	KIF5B	P33176	963 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	LY6K	Q17RY6	165 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-215	ENST00000502470	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	MFSD5	Q6N075	450 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470		Q7L0L9	218 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	RASEF	Q8IZ41	740 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	POLR2M	P0CAP2	368 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	NEK1	Q96PY6	1258 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	B4GALT4	O60513	344 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	SMARCA1	P28370	1054 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	IL31RA	Q8NI17	732 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGAP1	Q07960	439 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	PGM5	Q15124	567 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	DEFB123	Q8N688	67 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	RGS20	O76081	388 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	GH1	P01241	217 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	CALM1	P0DP23	149 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	CALM2	P0DP24	149 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	CALM3	P0DP25	149 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	CYP2C18	P33260	490 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-215	ENST00000502470	GNAQ	P50148	359 aa		31.34	■■■□□ 2.61

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