RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MTA3Q9BTC8 594 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 FANCLQ9NW38 375 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ASXL2Q76L83 1435 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MSCO60682 206 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 FUCA1P04066 466 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 BCL6P41182 706 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 LSAMPQ13449 338 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 BICRALQ6AI39 1079 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CEP68Q76N32 757 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 USP33Q8TEY7 942 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 APPBP2Q92624 585 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 CDC45O75419 566 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ASMTLO95671 621 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 SDHBP21912 280 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PDE6BP35913 854 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ERVFRD-1P60508 538 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 GPR85P60893 370 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRF1Q5T601 910 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 LBX2Q6XYB7 198 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM169Q96HH4 297 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-215ENST00000498284 C22orf46C9J442 243 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 AQP7O14520 342 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PLD2O14939 933 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SDE2Q6IQ49 451 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CABP7Q86V35 215 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NLRP10Q86W26 655 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CLDND1Q9NY35 253 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 OR14I1A6ND48 311 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 BTBD11A6QL63 1104 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 H7BY64 318 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 ENPP3O14638 875 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 EFCAB14O75071 495 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 RAPGEF3O95398 923 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 MPOP05164 745 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 GLI4P10075 376 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 FPR2P25090 351 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 TCEA2Q15560 299 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 KIZQ2M2Z5 673 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 Q8N1Y9 231 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NUDT19A8MXV4 375 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SRGAP3O43295 1099 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 KCNQ2O43526 872 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NTRK1P04629 796 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CYBBP04839 570 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 DBHP09172 617 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NAT1P18440 290 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 GUCY1A3Q02108 690 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 ALG1Q9BT22 464 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CDIP1Q9H305 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 X6R8D5 127 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 CRTAMO95727 393 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-215ENST00000498284 NR1I3Q14994 352 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms