RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ENTPD3	O75355	529 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP1A3	P13637	1013 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT2	P35908	639 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK8	P49336	464 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DPYD	Q12882	1025 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM83A	Q86UY5	434 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC15	Q8TF66	581 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	EPSTI1	Q96J88	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TEPSIN	Q96N21	525 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IDI2	Q9BXS1	227 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	INTS13	Q9NVM9	706 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CNTNAP1	P78357	1384 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FLT1	P17948	1338 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPY2	A6NKD2	308 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM232	C9JQI7	657 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CAVIN2	O95810	425 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SCG2	P13521	617 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	NOV	P48745	357 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	HUNK	P57058	714 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCC	Q00597	558 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXK2	Q01167	660 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MORC3	Q14149	939 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP2R5B	Q15173	497 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCA1	Q86XH1	822 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DGKH	Q86XP1	1220 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IFNK	Q9P0W0	207 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH8	P13535	1937 aa		6.62	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM75P	A6NK02	468 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	STXBP3	O00186	592 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	IKBKB	O14920	756 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TPM3	P06753	285 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TPM2	P07951	284 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CALM1	P0DP23	149 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CALM2	P0DP24	149 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CALM3	P0DP25	149 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	VSIG8	P0DPA2	414 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TERF1	P54274	439 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	GABPA	Q06546	454 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PDILT	Q8N807	584 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	PNMA1	Q8ND90	353 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	CNNM3	Q8NE01	707 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA20	Q8TB22	786 aa		6.61	□□□□□ -1.35
C4BPB-208	ENST00000492730	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms