RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 SCN9AQ15858 1988 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 FCGRTP55899 365 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 BEND4Q6ZU67 534 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 LINS1Q8NG48 757 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB16Q96NS5 453 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 MXD3Q9BW11 206 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.11□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 HMX2A2RU54 273 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 WNT10BO00744 389 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 KLRK1P26718 216 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXO4P98177 505 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 MOB2Q70IA6 237 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR63Q8IWG1 891 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 BCO2Q9BYV7 579 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.1□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TIAF1O95411 115 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLV1-40P01703 118 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 DRD2P14416 443 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TM4SF4P48230 202 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 USP11P51784 963 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRNDQ07001 517 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 AP3B2Q13367 1082 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 BEND3Q5T5X7 828 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 CD209Q9NNX6 404 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 RAD18Q9NS91 495 aa8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PRPF40A-210ENST00000489741 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 SNAP23O00161 211 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 IL1R1P14778 569 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP2B2Q01814 1243 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 NFIAQ12857 509 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 PDE3AQ14432 1141 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 SGO2Q562F6 1265 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 CERS5Q8N5B7 392 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 FBF1Q8TES7 1133 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF112Q9ULX5 631 aa8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ECEL1O95672 775 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 CTSBP07858 339 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ADH5P11766 374 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 FAAP100Q0VG06 881 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 LRP8Q14114 963 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP3K11Q16584 847 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ARTNQ5T4W7 220 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 XP32Q5T750 250 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF43Q68DV7 783 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.07□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 F6X3S4 739 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 TAF5LO75529 589 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 SASH1O94885 1247 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.06□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 HTTP42858 3142 aa8.05□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 UNCXA6NJT0 531 aa8.05□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D8O95759 1140 aa8.05□□□□□ -1.12
PRPF40A-210ENST00000489741 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms