RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487625.1

USP9X-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 2

Gene USP9X, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-208	ENST00000487625	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	IL13	P35225	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625		Q6ZPA2	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	SHOX	O15266	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	RAMP2	O60895	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	LMNB2	Q03252	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	GMIP	Q9P107	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	RLBP1	P12271	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625		F6X3S4	739 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	IFNGR1	P15260	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MAPK1	P28482	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ADRA1B	P35368	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PF4	P02776	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MAK	P20794	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	COMT	P21964	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625		Q6ZSN1	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	CCNF	P41002	786 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MLEC	Q14165	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	PRRX2	Q99811	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP9X-208	ENST00000487625	MASP2	O00187	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ONECUT2	O95948	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	NTRK1	P04629	796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	STAT5A	P42229	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	C21orf58	P58505	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	MPP2	Q14168	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	RHOV	Q96L33	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	FOXN1	O15353	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	LMF1	Q96S06	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	GNA15	P30679	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	SGSM2	O43147	1006 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	CD3E	P07766	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
USP9X-208	ENST00000487625	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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