RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 SCN5AQ14524 2016 aa25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CYP21A2P08686 494 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 DNAJB2P25686 324 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.13■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 IL23AQ9NPF7 189 aa25.13■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.12■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.12■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 RMDN3Q96TC7 470 aa25.12■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 EYSQ5T1H1 3165 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 CYP2C9P11712 490 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 PBX2P40425 430 aa25.11■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 RASIP1Q5U651 963 aa25.11■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 A6NJR5 290 aa25.1■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 CHST3Q7LGC8 479 aa25.1■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 HOMER1Q86YM7 354 aa25.1■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.09■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 OPLAHO14841 1288 aa25.09■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.09■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 E7EWF7 191 aa25.08■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 FGBP02675 491 aa25.08■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 GRIN2CQ14957 1233 aa25.08■■□□□ 1.61
USP40-215ENST00000484528 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.08■■□□□ 1.61
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USP40-215ENST00000484528 STXBP2Q15833 593 aa25.07■■□□□ 1.6
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USP40-215ENST00000484528 HERVK_113Q902F9 699 aa25.07■■□□□ 1.6
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USP40-215ENST00000484528 ZNF576Q9H609 170 aa25.07■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 PXMP2Q9NR77 195 aa25.07■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 ERICH2A1L162 156 aa25.06■■□□□ 1.6
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USP40-215ENST00000484528 MMP3P08254 477 aa25.05■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 HSD17B4P51659 736 aa25.05■■□□□ 1.6
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USP40-215ENST00000484528 TET1Q8NFU7 2136 aa25.04■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 ANTXR2P58335 489 aa25.04■■□□□ 1.6
USP40-215ENST00000484528 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.04■■□□□ 1.6
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