RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LTBRP36941 435 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RIPK4P57078 832 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ERVK-21P61565 698 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FOXO4P98177 505 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCLYQ96I15 445 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A1B0GUL7 405 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 STXBP3O00186 592 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AXIN1O15169 862 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PPP2R1AP30153 589 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 JAG1P78504 1218 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTK7Q13308 1070 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C12orf42Q96LP6 360 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.86□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF16BQ96L93 1317 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L15C9J2P7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L11C9JVI0 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L18D6R9N7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L22D6RA61 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L19D6RCP7 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L20D6RJB6 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATG7O95352 703 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ASNSP08243 561 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADRB1P08588 477 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ACTN1P12814 892 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTGIRP43119 386 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L24Q0WX57 530 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PICALMQ13492 652 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRIM50Q86XT4 487 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SIX5Q8N196 739 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DMDP11532 3685 aa6.85□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LINC01553A4QN01 128 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L12C9JPN9 530 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 USP17L21D6R901 530 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ERCC3P19447 782 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RASA1P20936 1047 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TINF2Q9BSI4 451 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLDND1Q9NY35 253 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.84□□□□□ -1.31
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A1W2PRU2 124 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CTAGE5O15320 804 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPINT1O43278 529 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 B4GALT4O60513 344 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BAIAP3O94812 1187 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IL2RAP01589 272 aa6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms